Colletotrichum è un genere di funghi sac (Ascomycota) con un ampio numero di specie. Sono riconosciuti globalmente come patogeni di molte piante selvatiche e della maggior parte delle specie vegetali coltivate. Questi organismi attaccano le colture nelle regioni tropicali e subtropicali, producendo perdite multimilionarie per l'agroindustria.
Funghi del genere Colletotrichum sono responsabili della putrefazione della frutta dopo la raccolta, dell'antracnosi e della peronospora su piante commercialmente importanti, tra cui banane, papaia, manioca, sorgo, caffè, fagioli, pomodori, peperoni e molte altre.
La classificazione tassonomica delle specie di Colletotrichum è controverso ed è attualmente in fase di revisione. Alcune caratteristiche morfologiche sono utili per differenziare gruppi di specie ma non sono utili in altri casi.
È stato suggerito che il genere Colletotrichum contiene complessi di specie criptiche strettamente correlate tra loro, con colonizzazione e comportamento di infezione simili.
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Il Colletotrichum fanno parte del gruppo dei funghi ascomiceti. Questi organismi sono caratterizzati dalla presentazione di una struttura riproduttiva sotto forma di un sacco. Il suo micelio è formato da ife settate.
Tra le altre caratteristiche degli ascomiceti in generale e del Colletotrichum in particolare sono:
La riproduzione sessuale comporta sempre la produzione di un ascus con due o più ascospore aploidi. Tollera temperature comprese tra 10 e 40 ° C, ma la loro temperatura ottimale di sviluppo è di 28 ° C.
Durante il processo di infezione, le specie fitopatogene del genere Colletotrichum colonizza inizialmente le cellule vegetali viventi abbattendo la parete cellulare, ma senza penetrare nella membrana plasmatica di queste cellule (questo impedisce la morte cellulare progressiva).
L'inizio dell'alimentazione delle parti morte della pianta da parte del fungo è associato a notevoli modificazioni morfologiche, genetiche e fisiologiche di quest'ultimo. Questi cambiamenti nel fungo causano una massiccia morte cellulare e la distruzione dei tessuti ospiti..
Il genere Colletotrichum, fu eretto da Corda nell'anno 1831, per descrivere la specie C. lineola, basato su materiale raccolto a Praga (Repubblica Ceca) dal fusto di una pianta erbacea non identificata della famiglia delle Apiaceae.
Allo stato attuale, sebbene il genere Colletotrichum è considerata valida, la definizione delle diverse specie è controversa ed è soggetta a revisione.
Alcune specie di questo genere sono confuse con le specie del genere Gleosporium, tuttavia questi ultimi non producono funghi negli acervuli.
Identificazione in base alle caratteristiche morfologiche dei funghi Colletotrichum è possibile in alcune specie in base all'ospite a cui sono associate, crescita miceliale, capacità di sporulazione e caratteristiche particolari di conidi, appressoria e sclerozi.
Per questo, è necessario eseguire colture artificiali del fungo e osservare la germinazione dei conidi.
Le caratteristiche morfologiche e la gamma di ospiti sono state tradizionalmente utilizzate per definire le specie fungine. L'uso eccessivo e inappropriato del tipo di ospite per la determinazione delle specie ha causato la proliferazione di nomi scientifici non necessari.
Ciò può essere dovuto, in parte, al fatto che specie vegetali con un'ampia distribuzione spaziale possono essere influenzate da diverse specie di funghi. A ciò contribuisce anche il fatto che alcune specie di Colletotrichum possono associarsi a una singola specie vegetale, mentre altre possono associarsi a più di un ospite.
A causa di quanto sopra, la biologia molecolare come strumento ha fornito nuove conoscenze sulla sistematica di questo gruppo di funghi, in particolare nella delimitazione delle specie e nella definizione delle relazioni inter e intraspecifiche..
La regione spaziatore trascrivibile interna dell'RNA ribosomiale (ITS) è la regione più comunemente utilizzata per differenziare i funghi. Questa regione ha dimostrato di essere di scarsa utilità per differenziare le specie di Colletotrichum.
La filogenesi multi-locus è stata ampiamente applicata per identificare le specie di questo genere. Utilizzando questa metodologia è stato suggerito che C. gloeosporioides si tratta in realtà di un complesso costituito da 23 taxa. Sono state descritte almeno 19 nuove specie sulla base della filogenesi dei locus multipli..
Altri strumenti suggeriti per aiutare a chiarire l'identità delle specie di Colletotrichum sono state le analisi biochimiche e fisiologiche.
Quando Corda, nel 1831, descrisse le prime specie del genere Colletotrichum (C. lineola), menzionava che questa specie forma acervuli lineari a forma di fuso, hanno un aspetto ricurvo, con conidi ialini con estremità acuminate e brune, di tonalità opaca, con setole subspatulate e punte acuminate..
In generale, i funghi del genere Colletotrichum possiedono corpi fruttiferi asessuati chiusi, setosi, a forma di cuscino, situati sopra o vicino all'epidermide, che si aprono in modo irregolare.
Lo stroma basale è di spessore variabile, dal marrone scuro all'incolore o quasi incolore. Le cellule stromali basali sono poliedriche, quasi dello stesso diametro e senza spazi tra di loro.
Questa condizione, nota anche come malattia dei punti neri sulle foglie, è causata da vari tipi di funghi. A volte è difficile determinare il genere e la specie del fungo responsabile di particolari attacchi.
Antracnosi causato da Collecotrichum è molto comune nelle piante da vivaio e in molte colture. Questa malattia può colpire foglie, rami, fiori e frutti. Le principali specie di Collecotrichum responsabili dell'antracnosi appartengono al complesso delle specie di C. gloeosporioides.
Le macchie fogliari sono la causa più comune di perdite di produzione, dovute all'antracnosi causata da Colletotrichum nelle piante da vivaio. La malattia può anche presentarsi come ruggine fogliare, macchie su steli, rami o fiori, cancro su stelo e rami o marciume della frutta. L'espressione dei sintomi dipende fortemente dalle specie vegetali infette.
Il danno economico causato da Colletotrichum nelle piante è generalmente il risultato di perdite dovute al marciume dei frutti in campo o dopo il raccolto. Questa malattia ha causato la perdita del 17% dei raccolti di papaia, del 30% del mango e fino al 50% dei raccolti di peperoncino.
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